Investigating the role of immnune-related genetic polymorphisms and the oral and gut microbiome composition in the initiation or prevention of automimmunity and type 1 diabetes

داء السكري من النوع 1 (T1D) هو مرض مناعي ذاتي يتميز بتدمير خلايا بيتا في البنكرياس. لقد شهدنا زيادة مقلقة في حالات داء السكري من النوع 1 خلال العقد الماضي في الكويت، مما يعكس وجود استعداد جيني بالإضافة إلى تأثير بيئي قوي. بالفعل، من المعروف أن داء السكري من النوع 1 له آلية مرضية متعددة العوامل تشمل الاستعداد الجيني، والعوامل البيئية، واستجابات الجهاز المناعي. في هذه الدراسة المرحلة الأولى، نهدف إلى تحديد عوامل الخطر الجينية والوراثية لداء السكري من النوع 1 في السكان الكويتيين. على وجه التحديد، نهدف إلى عزل الحمض النووي الجيني من حالات داء السكري من النوع 1 وأفراد العائلة غير المتأثرين المتطابقين لإجراء تسلسل الجينوم الكامل ورسم خرائط Bionano. بناءً على النتائج الجينية/الوراثية، نهدف إلى إجراء تصنيف عميق لخلايا الدم المحيطية (PBMC)، وقياس السيتوكينات المعوية، وتسلسل الميكروبيوم المعوي والفموي. علاوة على ذلك، نهدف إلى اختبار الأجسام المضادة الذاتية في عدد كبير من الأطفال داخل المجتمع. ستتيح نتائج هذه الدراسة فهماً أعمق لعلم الأمراض المناعي لداء السكري من النوع 1 في السكان الكويتيين، وتساعد في تحديد التدابير الوقائية المناسبة واستراتيجيات العلاج الشخصية. بالإضافة إلى ذلك، ستسمح فحص/قياس الأجسام المضادة الذاتية في عدد كبير من الأطفال بالتعرف المبكر على الذين هم في خطر تطور داء السكري من النوع 1، وبالتالي، تنفيذ استراتيجيات وقائية.

Type 1 diabetes (T1D) is an autoimmune disease characterized by pancreatic beta cell destruction. There has been an alarming increase in T1D cases over the last decade in Kuwait, which reflects the presence of both a genetic predisposition as well as a strong environmental influence. Indeed, it is well established that T1D has a multi-factorial pathogenesis involving genetic predisposition, environmental factors, and immune responses. In this first phase study, we aim to identify the genetic and epigenetic risk factors
for autoimmunity and T1D in the Kuwaiti population. Specifically, we aim to isolate genomic DNA from T1D cases and matched unaffected family members for whole genome sequencing and Bionano mapping. Depending on the genetic/epigenetic findings, we aim to conduct deep PBMC phenotyping, measure gut cytokines, and sequence the gut and oral microbiome. Moreover, we aim to test for autoantibodies in a large number of children within the population. Results from this study will enable a deeper
understanding of the immunopathology of T1D in the Kuwaiti population, and help determine appropriate preventative measures, and/or personalized treatment strategies. In addition, the screening/measurement of autoantibodies in a large number of children will enable early identification of those at risk of progression to T1D, and thus, implementation of preventative strategies.